Émile Marcotty avait été suspecté de complicité du vol de dynamite commis dans la nuit du 28 mars 1891 à la poudrière d’Oudret par notamment Hansen, Bustin et Langendorf. Toutefois lors du procès et malgré les graves soupçons pesant sur lui il fut acquitté avec deux autres compagnons, Marheyssen et Beduin.

Suite à une série d’attentats à Liège en mars-avril 1892, Émile Marcotty, membre du groupe anarchiste, fut arrêté dans la nuit du 1er au 2 mai avec 15 autres compagnons dont Jules Moineau (voir ce nom). Tous furent traduits le 18 juillet devant la cour d’assises de Liège dans un procès appelé « l’affaire des anarchistes ». Il y fut condamné à 15 ans de travaux forcés avec Matheyssen et Alphonse Lacroix, tandis que Moineau était condamné à 25 ans et Beaujean et Wolff à 20 ans.

Début 1897 les compagnons appelaient à une souscription en faveur de sa compagne et de leurs sept enfants.