Né de parents belges, Eugène Verhaeghen était le frère cadet d’Henri Arthur et d’Oscar. Préventivement à la manifestation du 1er mai 1892 les frère Verhaeghen avaient été arrêtés à Calais et expulsés de France. Le 27 avril ils s’étaient embarqués pour l’Angleterre accompagnés par une manifestation de 400 ouvriers tullistes. Le 4 juin 1897 l’arrêté fut suspendu et Eugène fut autorisé à résider en France.

Le 4 janvier 1900 l’arrêté contre ses deux frères fut également rapporté.